2015年11月25日，由國家海關(guān)總署、財政部、國家稅務(wù)總局、國家外匯總局四部委于聯(lián)合批準設(shè)立；鹽城港保稅物流中心是鹽城地區(qū)唯一一家保稅物流中心（B型），是允許多家企業(yè)進入并從事保稅倉儲物流業(yè)務(wù)的海關(guān)集中監(jiān)管場所。以港口為依托，以市場需求為導(dǎo)向，對完善我市沿海集疏運體系、做優(yōu)對外開放載體平臺、加速臨港企業(yè)集聚發(fā)展具有積極地推動作用。

鹽城港保稅物流中心現(xiàn)建有倉庫6棟，共計倉儲面積55000平方米，其中包括月臺式倉庫4棟、通用式倉庫1棟、冷鏈倉庫1棟；集裝箱、散貨堆場共5萬平方米；監(jiān)管倉庫，驗貨平臺，卡口及控制室，進境肉類、水果綜合型指定監(jiān)管場地，跨境電商監(jiān)管平臺。具備年處理貨物200萬噸以及10萬標箱的綜合能力。

2024年9月份，預(yù)計新投入使用14萬平方米通用倉庫，3.5萬噸冷庫；增加貨物年處理能力600萬噸，凍品年處理能力12萬噸。統(tǒng)一規(guī)劃建設(shè)將實現(xiàn)多種監(jiān)管場所分類監(jiān)管到多合一集約化監(jiān)管，充分發(fā)揮監(jiān)管資源的集聚效應(yīng)，形成管理合力，提高管理效能。

保稅物流中心進境肉類、水果綜合型指定監(jiān)管場地已于2023年通過海關(guān)總署國家級驗收，填補了江蘇中部地區(qū)無進境肉類及進境水果指定監(jiān)管場地的空白，為進出口企業(yè)提供開展進口肉類、水果等冷鏈業(yè)務(wù)的冷鏈基地。

根據(jù)鹽城市跨境電商“1+4+N”的整體布局，鹽城港保稅物流中心作為鹽城跨境綜試區(qū)核心區(qū)，將大力開展跨境電商“網(wǎng)購保稅進出口”（1210）模式業(yè)務(wù)，依托鹽城港跨境電商園，以“網(wǎng)紅經(jīng)濟+商圈產(chǎn)業(yè)+直播平臺”為核心優(yōu)勢，積極構(gòu)建“區(qū)塊鏈貿(mào)易”“跨境物流+云倉”“跨境+產(chǎn)業(yè)帶”等新業(yè)態(tài)模式，與國內(nèi)外企業(yè)開展跨境電商合作，打造鹽城地區(qū)國內(nèi)國際“雙循環(huán)”標桿電商園區(qū)，引導(dǎo)傳統(tǒng)企業(yè)向外貿(mào)轉(zhuǎn)型。

鹽城港跨境電商園地處大豐海港新城核心區(qū)，前期總投資1.5億元，占地面積2.1萬平方米，建筑面積3.9萬平方米，于2022年6月正式開園。主要進行自營和代理各類商品和技術(shù)的進出口業(yè)務(wù)服務(wù)，在鹽城港保稅物流中心擁有保稅區(qū)A2倉庫作為跨境電商監(jiān)管中心。打造集線上集成+跨境貿(mào)易+綜合服務(wù)功能型園區(qū)，全力構(gòu)造投資貿(mào)易便利化、監(jiān)管服務(wù)高效化、法制環(huán)境規(guī)范化、極具鹽城特色的沿海跨境電商創(chuàng)新示范園區(qū)。利用大豐港的地緣優(yōu)勢，打造以日韓市場為主、輻射東南亞及歐美地區(qū)的跨境電商進出口物流集散中心。